Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms