Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms