Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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