Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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NRF1Q16656 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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