Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms