Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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