Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TMPOP42166 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
TMPOP42166 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TMPOP42166 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms