Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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