Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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