Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.3 ms