Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PTPRCP08575 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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