Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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