Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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