Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms