Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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