Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SS18Q15532 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms