Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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