Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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CHD4Q14839 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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CHD4Q14839 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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CHD4Q14839 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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CHD4Q14839 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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CHD4Q14839 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
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CHD4Q14839 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
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CHD4Q14839 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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