Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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