Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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SF3B2Q13435 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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SF3B2Q13435 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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