Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CENPFP49454 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms