Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms