Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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