Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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USP18Q9UMW8 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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