Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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