Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms