Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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