Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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