Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SP140Q13342 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms