Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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