Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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HOXA13P31271 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXA13P31271 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA13P31271 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA13P31271 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA13P31271 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA13P31271 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA13P31271 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA13P31271 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA13P31271 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA13P31271 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA13P31271 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA13P31271 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA13P31271 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA13P31271 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXA13P31271 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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