Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTPRCP08575 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTPRCP08575 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTPRCP08575 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PTPRCP08575 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PTPRCP08575 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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PTPRCP08575 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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PTPRCP08575 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PTPRCP08575 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PTPRCP08575 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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