Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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EHD3Q9NZN3 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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EHD3Q9NZN3 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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