Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC002059.1-201ENST00000608014 477 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL161725.1-201ENST00000591577 1351 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ANKRD39Q53RE8 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RPS19P1-201ENST00000415286 434 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ANKRD39Q53RE8 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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ANKRD39Q53RE8 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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ANKRD39Q53RE8 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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ANKRD39Q53RE8 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ANKRD39Q53RE8 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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ANKRD39Q53RE8 IGHVII-15-1-201ENST00000517931 220 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 IGHVIII-82-201ENST00000522058 250 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ATOX1-205ENST00000522314 724 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AP000880.1-202ENST00000526487 588 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC233290.2-201ENST00000552852 390 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC055876.4-201ENST00000562515 712 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 TUBAP4-201ENST00000569261 416 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MIR3911-201ENST00000577791 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RN7SL378P-201ENST00000582657 298 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MIR2467-201ENST00000584559 81 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF559-205ENST00000586255 1016 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC008737.3-201ENST00000601661 221 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL592227.1-201ENST00000614748 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RANBP2-205ENST00000629728 156 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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