Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC38Q502W7 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms