Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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VPS72Q15906 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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VPS72Q15906 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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VPS72Q15906 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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VPS72Q15906 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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