Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
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VAMP3Q15836 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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VAMP3Q15836 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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VAMP3Q15836 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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VAMP3Q15836 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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