Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCM1Q15154 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCM1Q15154 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCM1Q15154 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCM1Q15154 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCM1Q15154 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCM1Q15154 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCM1Q15154 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCM1Q15154 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCM1Q15154 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PCM1Q15154 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCM1Q15154 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PCM1Q15154 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCM1Q15154 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms