Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms