Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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