Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms