Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTCH1Q13635 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms