Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms