Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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