Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SP140Q13342 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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