Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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