Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms