Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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PTPRMP28827 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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PTPRMP28827 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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PTPRMP28827 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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