Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms