Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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